Xã Quảng Khê nằm ở phía nam của huyện Quảng Xương. Cách thị trấn Quảng Xương 12 km về phía nam, cách thành phố Thanh Hóa 20 km

• Phía đông giáp các xã Quảng Lĩnh và Quảng Thạch, huyện Quảng Xương.
• Phía nam giáp xã Quảng Chính, huyện Quảng Xương.
• Phía tây giáp xã Trường Giang, huyện Nông Cống (ranh giới tự nhiên là sông Hoàng) và các xã Quảng Vọng, Quảng Trường, huyện Quảng Xương.
• Phía bắc giáp xã Quảng Lĩnh, huyện Quảng Xương.